（一）藻类

藻类植物含有各种不同的色素，能进行光合作用，生活方式为自养，绝大多数是水生。与药用关系密切的藻类主要在褐藻门、红藻门，少数在绿藻门。药用的有海藻、昆布等。

（二）菌类

药用部位主要为菌类的菌核、子实体或子座与幼虫尸体的复合体，这类中药称为菌类中药。

菌类一般不含有光合作用的色素，不能进行光合作用，营养方式为异养。中药药用以真菌门为主。真菌类中药以子囊菌纲和担子菌纲植物为最多。

子囊菌的主要特征是在特殊的子囊中形成子囊孢子繁殖，如冬虫夏草、蝉花、竹黄等；

担子菌的主要特征是在特殊的担子上形成担孢子来繁殖，药用部分主要是子实体，如马勃、灵芝等；菌核，如猪苓、茯苓、雷丸等。

（三）地衣类

地衣是藻类和真菌共生的复合体。