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按HC取自健康供体还是患者本身，HSCT被分为异体HSCT和自体HSCT.异体HSCT又分为异基因移植和同基因移植。后者指遗传基因完全相同的同卵孪生间的移植，供受者间不存在移植物被排斥和移植物抗宿主病（graft-versus-host disease，GVHD）等免疫学问题，此种移植几率仅约占1%.按HSC取自骨髓、外周血或脐带血，又分别分为骨髓移植（bone marrow transplantation，BMT）、外周血干细胞移植（peripheral bloodstem cell transplantation，PBSCT）和脐血移植（cord blood transplantation，CBT）。按供受者有无血缘关系而分为血缘移植（related transplantation）和无血缘移植（unrelateddonor transplantation，UDT）。按人白细胞抗原（human leukocyte antigen，HLA）配型相合的程度，分为HLA相合、部分相合和单倍型相合（haploidentical）移植。

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