溶栓治疗最严重的并发症是颅内出血。链激酶溶栓颅内出血的发生率在0.5%以下，tPA及第三代溶栓药物颅内出血发生率在0.5%～1%.如患者发生严重头痛、视觉障碍、意识障碍等，应考虑此诊断。颅内出血的危险因素包括：年龄＞75岁，使用纤维蛋白特异性溶栓药物，脑血管病史、女性、低体重者、入院时血压高等。另外，也与静脉肝素的剂量有关。其他出血并发症尚有胃肠道、腹膜后和其他部位出血，但如及时诊断和治疗常不致危及生命。

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