下丘脑最常见，其次为垂体、卵巢及子宫性闭经。
　　（1）下丘脑性闭经：以功能性为主。常见于紧张应激、体重下降、营养缺乏、过剧运动、药物（停药3~6月自然恢复）、颅咽管瘤（肥胖生殖无能营养不良症）。
　　（2）垂体性闭经
　　1）垂体梗死：常见为Sheehan希恩综合症，系产后大出血休克导致垂体缺血梗死。表现为闭经、无乳、性欲减退、脱发、第二性征减退等。
　　2）垂体肿瘤：常见催乳素瘤引起的闭经溢乳（乳溢-闭经）综合症。
　　3）空蝶鞍综合症：闭经、有时泌乳。
　　（3）卵巢性闭经：有卵巢早衰（40岁前绝经）、卵巢切除或组织破坏、卵巢功能性肿瘤、多囊卵巢综合症。
　　（4）子宫性闭经：Asherman综合征最常见（宫腔粘连或宫颈闭锁）、子宫内膜炎、子宫切除或放疗后。
　　（5）其他内分泌异常。