1.原发性闭经：少见，由遗传学原因或先天发育缺陷引起。
　　（1）第二性征存在的原发性闭经
　　1）米勒管发育不全综合征：始基子宫或无子宫、无阴道，外生殖器、输卵管、卵巢发育正常。
　　2）雄激素不敏感综合征：为男性假两性畸形。阴道凹陷状，子宫及输卵管缺如。
　　3）对抗性卵巢综合征。
　　（2）第二性征缺乏的原发性闭经
　　1）低促性腺素性腺功能减退：最常见者为Kallmann综合征，青春期延迟、无月经来潮、无性征发育、女性生殖器发育正常，常伴嗅觉障碍及先天性耳聋。
　　2）高促性腺激素性腺功能减退
　　①特纳综合征：卵巢不发育、原发性闭经、第二性征发育不良。
　　②46，XX条所索状性腺：卵巢呈条索状无功能实体，子宫发育不良，外生殖器女性，人工周期可有撤药性出血。
　　③46，XY条索状性腺，又称Swyer综合症，条索状性腺及原发性闭经。易发生性腺母细胞瘤及无性细胞瘤.