可以行胎儿分流术的疾病有尿路梗阻、胸腔积液、先天性肺气道畸形等。重度尿路梗阻的胎儿足月娩出时常合并严重肾盂积水、膀胱发育不良和肺发育不全而无法存活。对于尿路梗阻患儿采用宫内膀胱羊膜腔引流术，可以使婴儿存活率升高，羊水量回复正常，肺发育不良的比例降低。对胸腔积液的胎儿行胸腔羊膜腔引流术，使胎儿胸腔持续减压利于肺部扩张，有利于肺部代偿性生长，避免因肺发育不全导致的新生儿死亡。羊膜腔引流术还可用于治疗胎儿先天性肺气道畸形、腹腔巨大囊肿等疾病。