对凡有肝病史的中年，尤其是男性患者，如有不明原因的肝区疼痛、消瘦、进行性肝肿大者，应作AFP测定和选作上述其他检查，以期早期诊断。对于高危人群（肝炎史5年以上，乙型或丙型肝炎病毒标记阳性，35岁以上）进行普查，对高危人群检测AFP并结合超声显像检查（每年1～2次）是发现早期肝癌的根本措施，AFP持续低浓度增高但转氨酶正常，往往是亚临床期肝癌的主要表现。在排除活动性肝病、妊娠、生殖腺胚胎瘤的情况下，如AFP＞400 μg/L持续1个月，或AFP＞200 μg/L持续8周，则可诊断为原发性肝癌。
1．原发性肝癌进展到晚期诊断比较容易，关键是在亚临床期或临床早期的诊断。
2．高危人群的普查
对于中青年或中老年有肝炎病史的病人，原因不明的肝区疼痛、消瘦、进行性肝肿大者，应及时作详细检查。B型超声检查被广泛采用。结合甲胎蛋白的检测阳性率可达95%以上。
3．定性诊断
血清甲胎蛋白（α-FP，或AFP）测定：对原发性肝癌的诊断有肯定价值，甚至可以发现极小的肝癌，以至于在B超及CT检查时尚不能定位的癌肿。其缺点是只有70%左右肝癌病人AFP检测呈阳性反应。目前多用放射免疫法（RIA）或AFP单克隆抗体酶免疫（EIA）快速测定法检测。放射性免疫法测定持续血清AFP≥400 μg/L，并能排除妊娠、活动性肝病、生殖腺胚胎源性肿瘤等，即可考虑肝癌的诊断。临床上30％的肝癌病人AFP为阴性。如同时检测AFP异质体，可使肝癌的诊断率提高。确定原发性肝癌的方法为病理。
4．血液酶学及其他肿瘤标记物检查肝癌患者血清中γ-谷氨酰转移酶及其同工酶、异常凝血酶原、α-L-岩藻糖苷酶、α1-抗胰蛋白酶、酸性同工铁蛋白等可高于正常。但由于缺乏特异性，多作为辅助诊断。