1．庆大霉素偶致耳毒性，引起不可逆性听觉（耳蜗）和前庭功能受损，同时亦可出现肾毒性，发生率约2%～10%，虽滴眼剂比注射剂发生率小，但对儿童、肾功能不全者不宜长期应用。

2．阿昔洛韦滴眼液应用时偶有一过性烧灼感、疼痛、皮疹、荨麻疹。应用眼膏后极少数患者可即出现一过性轻度疼痛，可出现浅表斑点状角膜病变，但无需中止治疗，愈后亦无明显后遗症。

3．碘苷滴眼液长期应用可出现疼痛、瘙痒、眼睑过敏、睫毛脱落、角膜浑浊或染色小点，不宜消失。

4．应用抗菌药物制剂中加入糖皮质激素。虽具有抗菌、抗炎、加速治愈过程的优点，但有诱发真菌或病毒感染、延缓创伤愈合、升高眼压和导致晶状体混浊等风险，因此不应随意使用，除非患者是在眼病专科医师的密切监护下。特别是不能给尚未确诊的“红眼”患者开具这类药物，因为这种情况有时是由于难以诊断的单纯性疱疹病毒感染所致。如必须使用此类制剂，不应超过10天，并在使用期间定期测量眼压。