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分子对接种类主要包括：（1 ）刚体对接：指在对接过程中，研究体系（受

体和配体）的构象不发生变化。适合考察比较大的体系，如蛋白质和蛋白质间以

及蛋白质和核酸之间的对接。

（2 ）半柔性对接：指在对接过程中，研究体系尤其是配体的构象允许在一

定的范围内变化。适合处理大分子和小分子间的对接，对接过程中，小分子的构

象一般是可以变化的，但大分子是刚性的。

（3 ）柔性对接：指在对接过程中，研究体系的构象基本上可以自由变化的。

一般用于精确考虑分子间的识别情况。由于计算过程中体系的构象可以变化，所

以计算耗费最大。

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