病毒呈球形或丝状，其结构自内向外依次为核心、基质蛋白和包膜三层，根据核蛋白和M蛋白的抗原性不同，可将流行性感冒病毒分为甲、乙、丙型。根据血凝素（HA）和神经氨酸酶（NA）的不同又可分为不同的亚型。甲型流行性感冒病毒NA、HA抗原变异最频繁，易引起世界性大流行。